パズドラとは、ソーシャルゲームではポピュラーなキャラクターを集めてデッキを組むシステムを踏襲しながらも、それらが戦う舞台がパズルゲームという、他とは一線を画した新感覚のRPGである。
一般的なPRGがプレイヤーキャラクターに指示を与えて戦うのに対して、本作はパズルゲームを通じて戦闘を行うスタイルをとっている。
戦闘にパズルゲームを組み合わせることによって、シンプルかつ直感的に行えるシステムになっている。かつ、コンボをつなげると敵に大ダメージを与えることができる仕組みは、戦略性と不確定要素を同時に高めることに成功している。